Με βάση το καταστατικό του, τη διοίκηση του Α.Σ. Κουνάβων ασκούν η Γενική Συνέλευση των μελών και το Διοικητικό Συμβούλιο (Δ.Σ.).
Τα μέλη του Διοικητικού Συμβουλίου εκλέγονται από τα φυσικά πρόσωπα που είναι μέλη του ΑΣ και η θητεία τους είναι τετραετής. Στο Εθνικό Μητρώο Αγροτικών Συνεταιρισμών του ΥΠΑΑΤ είναι καταχωρισμένος με τον αριθμό 1301051.
To Δ.Σ. του συνεταιρισμού απαρτίζεται από τους:
– Πρόεδρος:
– Aντιπρόεδρος:
– Γραμματέας:
– Ταμίας:
– Μέλος: